直营店通常是指由总公司直接经营、投资、管理的连锁店。以下是判断直营店的几种常见方式：

分公司形式

如“张三公司南京分公司”或“张三公司苏州分公司”等，这些是总公司的直接分支机构。

绝对控股形式

如果“张三公司”属于“李四公司”绝对控股51%以上，并且两家公司的经营业务、模式相同，则“李四公司”可视为直营店。

关联关系形式

如果“张三公司”的绝对控股人“李四”名下有两家个体户门店且经营业务、模式相同，或者“李四”的配偶名下有两家个体户门店且经营业务、模式相同，根据夫妻财产共有权，这些门店可认定为直营店。

其他商务部门认可的直营店形式

包括特许人投资开设的控股子公司、分公司、以及控股自然人股东或配偶名义开设的个体工商户。

法律依据

《商业特许经营管理条例》和《商业特许经营备案管理办法》等相关法规规定了直营店的定义和条件。

直营店的终止

已经终止经营的直营店不能作为特许人申请备案的直营店，因为它们无法准确反映特许人的持续经营能力和成熟经营模式。

请注意，直营店的定义可能因地区和具体商务部门的规定而有所不同。在实际操作中，应参考当地商务主管部门的具体要求和标准