两个税率针对两种纳税人，享受的税收的政策不一样。

首先、3%为小规模纳税人增值税税率;17%为一般纳税人增值税税率

其次，小规模纳税人不能抵扣进项税，只有一般纳税人才能抵扣进项税额。

再者、一般纳税人抵扣进项税的条件：

(1)必须取得增值税专用发票才能抵扣进项税。

(2)取得小规模纳税人在国税代开的增值税专用发票，可以按3%抵扣进项税。

一般纳税人开增值税专用发票，小规模纳税人开普通发票，二者区别在于：

区别就在于购货方，取得增值税发票就可以抵扣，普通发票就不可以抵扣，不抵扣对他的是否交税就有影响。因此一般纳税人都要增值税发票。

1.增值税发票是具有一般纳税人资格的企业开具的，普通发票是小规模纳税人开具的。

2.增值税发票是电脑票，用专门的打印机在票面上打印，普通发票有很多是在票面上手写。

3. 进项增值税发票经过认证可以抵扣税金，普通发票不能抵税。