清包工程开票的步骤通常包括以下几点：

税务登记：

清包工首先需要到税务局进行税务登记，并取得税务登记证。

申请发票：

向税务局申请增值税专用发票或普通发票，并提供必要的资料，如身份证、营业执照等。

发票领购：

税务局审核通过后，发放发票领购簿。

开具发票：

在工程完成后，根据合同约定，向业主开具增值税专用发票。填写业主名称、地址、电话、合同编号等信息，并确保发票的真实性、合法性。

发票交付：

将发票联交给业主，并将发票存根联、记账联留存。

纳税申报：

按月或季度向税务局申报纳税，缴纳增值税。

请注意，清包工在开具发票时，要确保发票信息准确无误，以免造成不必要的麻烦。此外，根据税法规定，清包工可能适用不同的税率，例如一般纳税人可能适用9%的税率，小规模纳税人可能适用3%的税率。