小规模纳税人开具增增值税专用发票和平时开具增值税普通发票的会计账务处理是一样的，会计分录是借记应收账款/银行存款等，贷记主营业务收入和应交税费—应交增值税。缴纳增值税时，会计分录是借记应交税费—应交增值税，贷记银行存款。

增值税小规模纳税人与一般纳税人的标准区分是连续12个月不含税销售额是否超过500万，如果连续12个月不含税销售不超12个月，则为增值税小规模纳税人，否则为一般纳税人。

根据目前增值税暂行条例规定，一般纳税人按照增值税适用税率缴纳增值税，而小规模按照征收率缴纳增值税，一般情况下，小规模纳税人的增值税征收率是3%，目前，因为疫情，小规模纳税人可以按照1%的税率缴纳增值税。

由于小规模纳税人开具了增值税专用发票，购买方可以抵扣增值税进项，因此，增值税必须缴纳，而不能享受免征增值税的优惠，即小规模纳税人月不含税销售额在15万以内或者季度不含税销售额在45万以内免征增值税的优惠。