多税率抵扣是指企业在计算应纳税额时，可以抵扣已缴纳的多个不同税率的税款。以下是具体的操作步骤和注意事项：

区分不同税率的应纳税额

企业应当分别核算适用不同税率的货物或应税劳务的销售额。

计算每个税率的抵扣额度

对于每个税率的进项税额，需要计算可抵扣金额。

抵扣顺序

按照税率从低到高的顺序进行抵扣。

余额处理

若抵扣后仍有余额，可结转至下期继续抵扣。

合规性

多税率抵扣必须符合相关税法规定，确保操作合规。

发票认证

只有税务局认证过的发票或认可的扣税凭证才可以用于抵扣。

注意事项

发票上标明的其他费用（如装卸费、保管费等）通常不能抵扣。

特定项目（如购进农产品）的抵扣可能涉及不同的扣除率。