农产品进项税抵扣的具体计算方式取决于农产品的类型、购买方的情况以及农产品的用途。以下是几种常见情况的抵扣税率和计算方法：

一般纳税人购进已税农产品

可以凭增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书进行抵扣。

抵扣税率为11%。

计算公式：进项税额 = 发票上注明的增值税额。

一般纳税人购进免税农产品

可以按照11%的扣除率计算抵扣进项税额。

如果加工后的产品适用17%的税率，则按照13%计算抵扣进项税额。

纳税人购进流通环节全免税的农产品

可以按照规定的扣除率计算抵扣进项税额。

收购烟叶的进项税额

涉及烟叶税，计算比较特殊。

购买方直接向农业生产者购进农产品

可以凭借农产品销售发票或农产品收购发票进行抵扣。

若用于生产9%税率货物，按照9%抵扣进项税额。

若用于生产销售或委托加工13%税率货物，按照10%抵扣进项税额。

若同时用于生产13%税率货物和其他货物服务且未分别核算，应按照9%抵扣进项税额。

购进流通环节征税的农产品

若销售方是一般纳税人，可凭增值税专用发票进行抵扣。

若销售方是小规模纳税人，可凭3%或1%征收率的专用发票进行抵扣。

取得3%征收率的专用发票按9%或10%抵扣进项税额，取得1%征收率的专用发票按照1%抵扣进项税额。

进口农产品可凭海关进口增值税专用缴款书进行抵扣。

请注意，税法规定可能会更新，具体抵扣情况应以最新的税法规定和税务机关的解释为准。如果您需要最新的信息，请咨询当地税务机关或专业税务顾问