代付款项通常会计入“其他应付款”科目。当企业代替其他企业或个人支付款项时，这笔款项被视为企业的负债，因此应记入“其他应付款”科目。在支付款项时，会计分录为借记“其他应付款”科目，贷记“银行存款”科目。

如果代付款项涉及到增值税进项税额，还需要在借方记录“应交税费——应交增值税（进项税额）”。

需要注意的是，代付款项在会计处理上不直接计入企业的收入或支出，因为这并不是企业自身的经济活动，而只是企业为其他企业或个人提供的服务。