土地增值税的纳税流程和计算方法如下：

纳税流程

办理税务登记

土地转让双方应在土地转让合同签订之日起30日内，前往当地税务部门办理税务登记，并领取《税务登记证》。

缴纳土地增值税

土地转让完成后，转让受让方应在30日内，持税务登记证、土地转让合同等相关材料到当地税务部门缴纳土地增值税。

确认税款

税务部门会对纳税人缴纳的土地增值税进行核算，如果存在差异，会通知纳税人进行补缴或退税。

纳税申报表

需要填写土地增值税纳税申报表，并按照相关规定进行申报和缴纳。

计算方法

土地增值税按照纳税人转让房地产所取得的增值额和四级超率累进税率计算征收。具体计算步骤如下：

确定扣除项目金额

包括取得土地使用权所支付的金额、开发土地的成本费用、新建房及配套设施的成本费用、与转让房地产有关的税金及其他扣除项目。

计算增值额