当收到工程款项但无发票时，会计处理通常如下：

预收账款处理

借：银行存款

贷：预收账款

无票收入处理（如果不开具发票）：

需要缴纳相关的流转税和所得税。

与对方财务沟通，出具一份现金收据并盖章，相当于退还对方的预收款。

请注意，一般情况下，收据是不能入账的，必须取得正式的发票。如果合同中有特别规定，则按照合同执行。