公司进行零报税的操作流程通常包括以下几个步骤：

登录电子税务局系统

使用纳税人识别号和密码登录税务局指定的电子税务局平台。

进入纳税主界面

在系统中找到“我要报税”-“税费申报及缴纳”等相关栏目。

填写纳税人信息采集表

根据提示填写必要的纳税人信息。

填写相关纳税申报表

填写税额抵减情况表、申报表主表辅助填报工具以及增值税纳税申报表，并将税额填写为零。

如果适用，填写营改增试点企业税负变化表，并补零保存。

填写代征地税申报表。

提交申报材料

携带填写好的纳税申报表（通常需要3份）以及资产负债表和利润表（各2份）前往税务局，交给税务大厅和专管员，并在这些表上盖公章。

确认申报成功

在电子税务局系统中检查申报日期和状态，确保申报成功。

请注意，零申报并不意味着不需要进行任何财务记录或报告。即使没有产生应税收入，公司仍需要按照规定的时间和程序进行零申报，并确保财务报表反映了公司的真实财务状况。