公司卖掉车辆时需要缴纳的税种主要包括增值税、印花税，可能还会涉及到车辆购置税、企业所得税等。以下是具体的税务处理方式：

增值税

如果公司车辆的售价超过了其固定资产原值，应按照4%的征收率减半征收增值税。

如果售价未超过固定资产原值，则免征增值税。

一般纳税人销售车辆时，如果之前抵扣了进项税额，则按17%计算销项税额；如果未抵扣进项税额，或者是小规模纳税人，则按3%的征收率减按2%计算应纳增值税额。

印花税

根据“产权转移书据”计算印花税，税率为万分之五。

车辆购置税

购买二手车时，购买者应向原车主索要《车辆购置税完税证明》。

如果车辆已经办理过免税手续，购买者应当到税务机关重新办理申报缴税或免税手续。

企业所得税

在计提折旧时，可以减少企业所得税的缴纳额。

销售收入与车辆账面价值之间的差额应计入资产处置损益或者营业外收入，并入全年应纳税所得额计算缴纳企业所得税。

税务申报和缴纳

公司通常在下月初申报并缴纳增值税。

需要在税务局网站进行税务系统登记，填写纳税登记表，并提交给工作人员。

增值税的具体计算方法和申报流程应遵循当地税务局的规定。

请注意，税法规定可能会有更新，具体操作时应参考最新的税法规定和地方税务局的具体指导。