当企业遇到不能确认收入的情况时，可以采取以下几种会计处理方法：

预收账款处理

开具发票时，如果已经确定要缴纳税款，可以将收入计入预收账款科目，并注明是税后的。

当收入可以确认时，从预收账款中转出，并确认主营业务收入和相应的增值税销项税额。

发出商品处理

如果商品已经发出但不符合收入确认条件，可以增设“发出商品”科目，用以反映尚未确认销售收入的商品成本。

应收账款处理

在不能确认收入时，可以将应收账款科目用于挂账，待收入确认后再进行收入确认或冲销往来。

销售退货处理

如果遇到销售退回的情况，需要对已确认的收入进行冲减，并相应调整库存商品和相关的税费。

新收入准则下的处理

根据新收入准则，对于已开票但不确认收入的情况，需要按照销售退货的账务处理方式进行操作。

请根据具体情况选择合适的会计处理方法，并确保符合相关税法规定。