出纳短款通常首先计入“待处理财产损溢”科目，这是一个临时过渡科目，用于存放待查明原因或等待处理的财务事项产生的损益。在查明原因后，根据具体情况，短款可能会被计入“管理费用”、“其他应收款”等科目。

具体的会计分录如下：

1. 发现出纳短款时：

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借：待处理财产损溢

贷：库存现金

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2. 核查原因后，如果是责任人赔偿：

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借：其他应收款

贷：待处理财产损溢

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3. 如果短款原因无法查明：

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借：管理费用

贷：待处理财产损溢

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请根据实际情况进行会计处理，并确保账目准确