当企业的进项税额不足以抵扣应纳税额时，可以采取以下几种处理方式：

暂不处理

将不足部分留待下一个纳税期抵扣。

注意及时抵扣，避免过多积压。

补缴税款

在规定时间内补缴税款，以满足税务要求。

注意补缴可能带来的罚款和滞纳金。

申请退税

如果进项税额明显超过应纳税额，可申请退税。

退税金额为进项税额与应纳税额之间的差额。

催促供应商开具发票

供应商未能及时开具发票是常见原因，应催促其及时提供。

规范企业发票管理

确保所有业务都有相应的发票支持。

定期核查发票，避免遗漏。

利用税收优惠政策

了解并利用国家普惠政策，如小微企业政策。

了解地方性税收优惠政策，如税收园区优惠。

优化资金管理

延长支付周期，优化应收账款管理。

合理配置资金，减少资金紧张。

分析和优化进项结构

分析收入来源和进项结构，优化销售策略或产品组合。

控制现金流

确保企业现金流稳定，避免影响正常经营。

寻求专业税务咨询

遇到复杂情况时，建议寻求专业税务咨询服务。

请根据企业的具体情况选择合适的处理方式。