对于员工通勤补助的记账处理，通常有以下几种方法：

专款专用的会计处理

当补助发放时，会计凭证中科目以“工资福利发放-交通补助”等字样写明。

借方科目为“应付职工薪酬”，贷方科目为“经费支出-交通补助”等。

计入工资的会计处理

将交通补助计入工资支出，会计凭证中科目以“工资福利发放-薪酬总额”等字样写明。

借方科目为“应付职工薪酬”，贷方科目为“银行存款”等。

作为职工福利费处理

计入应付职工薪酬科目核算。

计提时：借：生产成本/制造费用/销售费用/管理费用等，贷：应付职工薪酬——职工福利费。

报销时：借：应付职工薪酬——职工福利费，贷：银行存款/库存现金等。

请根据公司的具体情况选择合适的会计处理方法，并确保遵守当地的会计准则和法规