理财公司在运营过程中需要缴纳的主要税种包括：

增值税：

对于提供的服务，如基金销售、保险产品销售等，可能需要缴纳增值税。

企业所得税：

对理财业务的盈利部分征收，通常按照盈利额的一定比例计算。

附加税费：

包括城市维护建设税、教育费附加等，根据增值税和营业税之和的一定比例缴纳。

个人所得税：

代扣代缴投资者或合伙人的个人所得税。

房产税：

对于拥有自有房产的理财公司，需要缴纳房产税。

土地使用税：

对于拥有自有土地的理财公司，需要缴纳土地使用税。

车船使用税：

对于拥有车船等交通工具的理财公司，需要缴纳车船使用税。

印花税：

在开立实收资本账户、签订投资合同等情况下需要缴纳。

契税：

在签订投资合同时可能需要缴纳。

防洪护堤税（水利基金）：

根据当地政策可能需要缴纳。

请注意，具体的税率和免税政策可能因地区和政策变动而有所不同，建议咨询当地税务局获取最准确的信息