水利基金应计入“税金及附加”科目进行核算。这一科目属于损益类科目，用于记录企业在经营活动中产生的相关税费，如消费税、城市维护建设税、资源税、教育费附加、房产税、土地使用税和车船使用税等。

具体的账务处理如下：

计提水利基金时：

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借：税金及附加

贷：应交税费-应交水利建设基金

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缴纳水利基金时：

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借：应交税费-应交水利建设基金

贷：银行存款

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请根据最新的会计准则和实际情况进行会计处理