垫付的住宿费应计入管理费用科目。具体会计分录如下：

1. 如果员工垫付的住宿费是为了出差，报销时：

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借：管理费用——差旅费

贷：其他应付款——××员工

```

2. 如果员工垫付的住宿费是为了招待外地客户，报销时：

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借：管理费用——业务招待费

贷：其他应付款——××员工

```

3. 如果员工垫付的住宿费是用于其他管理活动，报销时：

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借：管理费用——其他管理费用

贷：其他应付款——××员工

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在实际操作中，应根据具体情况确定入账科目，并确保财务记录的准确性