扶贫款项在会计科目中的处理取决于款项的使用主体和具体用途。以下是主要的会计科目处理方式：

企业支付扶贫资金

如果企业支付的扶贫资金不属于其内部的生产经营活动支付的费用，应计入“营业外支出—扶贫支出”科目。

会计分录示例：

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借：营业外支出—扶贫支出

贷：银行存款等

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政府部门或事业单位

政府部门或事业单位支付的扶贫款项可以计入“拨出经费—资助费”或“专项支出”等科目。

其他会计科目处理

扶贫资金核算方法可能包括“公积公益金”科目、“在建工程”科目、“补助收入”科目或“专项应付款”科目。

请根据具体情况选择合适的会计科目进行核算。