垫付的运费通常应计入应收账款科目。具体的会计分录如下：

1. 当企业垫付运费时：

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借：应收账款

贷：银行存款

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2. 当收回垫付的运费时：

```

借：银行存款

贷：应收账款

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应收账款是企业因销售商品、提供劳务等经营活动应向购货单位或接受劳务单位收取的款项，其中包括代购货单位垫付的包装费、运杂费、保险费等。

需要注意的是，如果企业是主营运输单位，提供运输货物取得的运输收入则属于主营业务收入，会计分录会有所不同。

请根据您的具体情况选择合适的会计科目进行处理