抵消存货在会计报表中的影响主要体现在以下几个方面：

资产负债表：

内部交易存货抵消会影响资产在资产负债表上的列示。如果内部交易涉及存货的购买和销售，那么在抵消过程中，相关的存货账户将会被调整，以反映存货的真实价值。

利润表：

内部交易存货抵消会影响利润表中的收入和成本项目。通过抵消，可以确保收入和成本的正确匹配，避免将内部交易产生的收入或成本错误地计入报表。

现金流量表：

虽然内部交易存货抵消不会影响实体的现金流，但它会影响现金流量表中的相关项目。抵消过程会消除内部交易产生的现金流量，从而影响报表上现金及现金等价物的变动。

税务报表：

内部交易存货抵消对税务报表也有影响，因为它会影响可抵扣暂时性差异和递延税项的计算。

内部交易存货抵消是会计报表编制过程中的一个重要步骤，它有助于确保报表的准确性，反映企业的真实财务状况，并符合会计原则和税务法规。