船务代理服务涉及的税种主要包括增值税、营业税、城建税、教育费附加、所得税等。以下是具体的税率和缴税方式：

增值税

船舶代理服务属于现代服务业中的商务辅助服务，应缴纳6%的增值税。

若服务中包含货物运输、仓储等业务，需要分别核算销售额，并适用不同的税率。

营业税

过去，船务代理可能按运输收入的3%缴纳营业税，但这一规定可能已经更新。

城建税及教育费附加

城建税通常按应纳流转税额的一定比例（如7%）缴纳，教育费附加则按一定比例（如3%）缴纳。

所得税

船务代理公司通常需按照25%的税率缴纳企业所得税。

其他税项

根据国家相关规定缴纳其他税项。

缴税的具体计算方法和申报期限应遵循当地税务机关的规定。请注意，税法和相关政策可能会有更新，因此建议咨询当地税务机关或专业税务顾问以获得最准确的信息