零余额账户的记账方法如下：

设立账户

设立一个零余额账户，用于记录所有收入和支出。

收入记录

当收到收入时，借记零余额账户，表示账户金额增加。

例如，收到财政授权支付额度到账通知时，借记“零余额账户用款额度”科目，贷记“财政补助收入”科目。

支出记录

当发生支出时，贷记零余额账户，表示账户金额减少。

例如，发生日常业务支出时，借记相关科目，贷记“零余额账户用款额度”科目。

余额处理

记账时，需要确保借方和贷方的总额相等，以保持账户余额为零。

如果余额为零，在余额栏内用“Q”表示，并在“借或贷”栏内写“平”字。

特殊事项处理

如果单位收到代理银行转来的支付通知，并且该笔支出不属于零余额账户的核算内容，则根据通知书上的金额增加银行存款。