根据最新的个人所得税法规定，如果月工资收入为40000元，并且已经扣除了各项社会保险费用，那么应缴纳的个人所得税计算如下：

1. 应纳税所得额 = 工资收入金额 - 各项社会保险费 - 起征点（5000元）

2. 应纳税所得额 = 40000元 - 0元 - 5000元 = 35000元

3. 应纳个人所得税税额 = 应纳税所得额 × 税率 - 速算扣除数

4. 应纳个人所得税税额 = 35000元 × 30% - 2755元

5. 应纳个人所得税税额 = 10500元 - 2755元 = 7745元

所以，月工资40000元在扣除社保费用后应缴纳的个人所得税为7745元