开5000元的增值税发票，根据不同的税率和情况，需要缴纳的税费可能有所不同。以下是一些可能的计算方式：

1. 如果是一般纳税人，增值税税率为16%，则应缴纳的增值税为：

```

5000元 / （1 + 16%） * 16% = 5000元 / 1.16 * 0.16 ≈ 689.65元

```

2. 如果是一般纳税人，增值税税率为10%，则应缴纳的增值税为：

```

5000元 / （1 + 10%） * 10% = 5000元 / 1.1 * 0.1 ≈ 454.55元

```

3. 如果是小规模纳税人，增值税税率为3%，则应缴纳的增值税为：

```

5000元 * 3% = 5000元 * 0.03 = 150元

```

4. 如果适用的是简易征收办法，增值税税率为3%，则应缴纳的增值税为：

```

5000元 * 3% = 5000元 * 0.03 = 150元

```

请注意，以上计算仅为增值税的计算，实际应缴税费可能还包括城建税、教育附加、地方教育附加、印花税、个人所得税等其他税费，具体数额需要根据当地税法和具体情况进行计算。