根据最新的个人所得税法规定，年收入12万应缴纳的个人所得税为990元。具体计算如下：

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年度个人所得应缴税款 = （累计税前收入 - 累积五险一金 - 累积专项附加扣除 - 累积减除费用） × 税率 - 速算扣除数

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假设没有专项附加扣除和社保扣除，那么计算如下：

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年度个人所得应缴税款 = （120000元 - 60000元基本免税额） × 3%的税率 = 1800元 × 3% = 540元

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然而，这个计算结果与之前的信息不一致，可能是因为税率或速算扣除数有所调整。为了得到最准确的答案，请参考最新的税法规定或咨询专业的税务顾问