应交税费审计主要包括以下几个方面：

应交税费内容真实性的审计

核实增值税和营业税等内容是否真实。

税种及税率的核对

检查企业应缴的各种税金种类和税率是否正确。

纳税申报情况的核实

审查纳税申报表和相关税金凭证的真实性和准确性。

纳税计算方法的审查

验证应缴税款的计算方法是否正确，检查是否存在逃税、漏税行为。

税收减免情况的核查

审查企业享受的税收减免政策是否符合规定。

业务控制制度审计

审查与应交税费相关的内部控制制度是否健全有效。

业务处理流程审计

审查应交税费的会计处理流程是否符合国家财税法规。