企业自有房产需要缴纳的税种主要包括：

房产税：

按照房产原值的一定比例（通常是房产余值，即原值减去累计折旧后的价值）计征。

城市维护建设税：

作为房产税的附加税，根据房产税的税率计征。

土地使用税：

如果公司拥有土地使用权，需要根据土地面积和使用性质缴纳。

印花税：

在房产交易过程中，对于书立的房地产凭证（如购房合同）缴纳。

契税：

当公司购买房产时，根据房产所有权转移的情况缴纳，税率通常在3%到5%之间。

增值税：

如果涉及房产销售，可能需要缴纳增值税。

土地增值税：

在出售房产时，如有增值，可能需要缴纳。

其他税费：

可能包括教育费附加、地方教育附加、水利基金、工会筹备金、残疾人保障金等。

企业应按照国家规定履行纳税义务，通过“应交税费”科目反映各种税费的交纳情况，并按照应交税费项目进行明细核算。需要注意的是，具体税率和应缴税额可能因地区、企业类型和税收政策的变化而有所不同，企业应以最新的税法规定和地方政策为准。