水利基金的入账处理应遵循以下步骤：

计提水利基金

借：税金及附加

贷：应交税费——应交水利建设基金

缴纳水利基金

借：应交税费——应交水利建设基金

贷：银行存款

水利建设基金是专项用于水利建设的政府性基金，通常按照企业的销售收入的一定比例（如0.1%）来计算和缴纳。

请根据您公司的具体情况以及所在地的具体规定进行会计处理。需要注意的是，会计政策可能会有所变动，因此最好参考最新的会计准则和地方规定