工程发票的比例通常指的是发票金额与合同金额之间的比例。这个比例可以根据工程的实际完成情况来调整，具体计算方法是：

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发票合同额占比 = （发票金额 ÷ 合同金额）× 100%

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例如，如果一个工程合同额为100万，根据完工进度开具了60万的发票，那么发票合同额占比就是：

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发票合同额占比 = （60万 ÷ 100万）× 100% = 60%

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此外，工程发票的税率根据不同的服务和项目类型可能会有所不同。一般情况下，建筑服务类发票的税率可能为3%、10%、11%或16%，具体取决于企业选择的计税方法以及是否为老项目或跨地区服务等。

请根据您的具体情况来确定适用的税率和计算比例。