批发企业在运营过程中需要缴纳的主要税种包括：

增值税

一般纳税人：按销售收入的17%或13%缴纳（具体税率取决于商品类型和企业的具体情况）。

小规模纳税人：按销售收入的4%缴纳。

城市维护建设税

税率通常为7%，5%，或1%，根据实际缴纳的增值税税额计算。

教育费附加

通常按缴纳的增值税的3%缴纳。

地方教育费附加

通常按缴纳的增值税的2%缴纳。

企业所得税

根据企业的盈利状况和税收政策，对经营所得收入进行征收，基本税率为25%。

个人所得税

对员工工资收入代扣代缴，根据工资水平按照相应税率缴纳。

印花税

根据购销合同金额或账本金额缴纳，以及按“实收资本”与“资本公积”之和的万分之五缴纳。

房产税

按自有房产原值的70%*1.2%缴纳。

车船税

根据车辆类型和数量缴纳。

其他可能的税种

包括城镇土地使用税、土地增值税、车辆购置税、契税和耕地占用税等，但这些税种一般企业不涉及，或影响较小。

请注意，上述信息可能随政策调整而变化，具体税率和计算方法应以当地税务局的规定为准。