运输公司的车辆维修费用入账方式取决于具体情况，以下是几种可能的会计处理方式：

管理费用

如果车辆用于管理部门，维修费用应计入“管理费用”科目。

会计分录示例：

```

借：管理费用—车辆维修费

贷：银行存款

```

主营业务成本

如果车辆直接参与公司的运输业务，维修费用可以计入“主营业务成本”科目。

会计分录示例：

```

借：主营业务成本—车辆维修费

贷：银行存款

```

销售费用

如果车辆用于销售部门，维修费用应计入“销售费用”科目。

会计分录示例：

```

借：销售费用—车辆维修费

贷：银行存款

```

在建工程

如果车辆用于在建工程项目，维修费用应计入“在建工程”科目。

会计分录示例：

```

借：在建工程—车辆维修费

贷：银行存款

```

应付账款

当公司向外部服务商支付维修费用时，这笔费用应计入“应付账款”科目。

会计分录示例：

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借：应付账款—维修费

贷：银行存款

```

增值税处理

一般纳税人支付修理费并取得增值税专用发票时，可以抵扣进项税额。

会计分录示例：

```

借：管理费用—车辆维修费

应交税费—应交增值税（进项税额）

贷：银行存款

```

请注意，上述会计分录示例仅供参考，具体会计处理应遵循当地会计准则和相关法规。