免税农产品抵扣主要包括以下方面：

农产品免税发票

种子、化肥、农药、农用机械设备、农业生产资料、农产品收购、销售等环节的发票。

农业生产、加工、销售等环节的运输、仓储、保险、检验检疫等服务发票。

进项税额计算

纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，可以加计1%抵扣进项税额。

农产品销售发票或收购凭证上注明的农产品买价和9%的扣除率计算抵扣进项税额。

免税农产品种类

粮食、食用植物油、食用盐、自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、二甲醚、沼气、居民用煤炭制品、图书、报纸、杂志、音像制品、电子出版物、饲料、化肥、农药、农机、农膜等。

农业生产者销售的自产农产品、农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品、制种企业在特定生产经营模式下生产销售种子、从事蔬菜批发、零售的纳税人销售的蔬菜等。

运费抵扣

农产品收购金额乘以13%计算进项税额。