工程软件通常会计入以下科目：

无形资产：

如果软件的成本较高，并且企业拥有该软件的所有权，则可能将其计入无形资产科目。根据《企业会计准则第6号-无形资产》，外购无形资产的成本包括购买价款、相关税费以及直接归属于使该项资产达到预定用途所发生的其他支出。

固定资产：

如果软件的成本较低，或者企业只是租赁而非拥有，可能会计入固定资产科目。

长期待摊费用：

在某些情况下，如果软件的成本较高，企业可能会选择将其计入长期待摊费用，随后通过摊销的方式计入管理费用。

管理费用：

软件的后期维护费用通常应费用化，即计入管理费用科目。

具体会计处理应根据企业的会计政策和软件的实际使用情况来确定。