小规模纳税人的运费收入需要按照增值税法规定缴纳增值税。根据最新的信息，小规模纳税人的运费增值税按照3%的征收率计算应纳税额。具体计算公式如下：

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小规模纳税人增值税应纳税额 = 运输服务不含税收入额 × 适用税率

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这里的适用税率是3%。

需要注意的是，小规模纳税人付给其他单位的运费，相当于购买运输劳务，因此这部分费用不交增值税。然而，如果小规模纳税人同时从事货物销售，那么与货物销售相关的运费则需要并入销售额中，按照规定的征收率计算缴纳增值税。

请根据您的具体情况计算应纳税额，并确保按时申报缴纳相应的税款