公司支付的稿费应计入管理费用—劳务费科目进行核算。具体的会计分录如下：

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借：管理费用—劳务费

贷：库存现金或银行存款

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如果稿费是发放给员工的，则相应的会计分录为：

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借：应付职工薪酬

贷：库存现金或银行存款

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稿费的个人所得税计算方法是，以个人每次取得的收入，定额或定率减除规定费用后的余额为应纳税所得额。