当增值税发票过了抵扣期，处理方式取决于发票是否仍在有效期内以及是否存在客观原因导致逾期。以下是处理步骤和注意事项：

确认发票有效期

首先确认发票是否在有效期内。

联系开票方

如果发票过期，尝试联系开票方请求重新开具。

税务机关申请

如果开票方无法配合，向税务机关说明情况，看是否可以申请延期抵扣。

账务处理

如果发票过了抵扣期限，且无法重新认证抵扣，需要将专用发票按普通发票入账处理。

会计分录示例：

进项税额处理

如果账务已处理，需要做进项税转出。

会计分录示例：

贷：应交税费-应交增值税（进项转出）