预缴申报时抵扣的方法通常包括以下几个步骤：

计算应纳税款：

在计算应纳税款时，将已预缴的税款作为抵扣项目。

填写抵扣信息：

在税务申报时，填写预缴税款的抵扣信息。

抵扣计算：

税务部门会根据申报情况自动计算抵扣金额。

抵扣限制：

预缴税款的抵扣通常只能在本年度内进行，不得跨年度抵扣。

增值税抵扣：

对于增值税，企业可以将预缴的增值税从当期应纳税额中扣除，如果预缴的税款超过应纳税额，差额部分可以作为留抵税额，在下期申报纳税时继续抵扣。

企业所得税抵扣：

在企业所得税方面，企业可以将预缴的税款从应缴税款中抵扣，如果预缴税款超过了应缴税款，企业可以申请退还多余的部分。

填报明细：

在抵扣时，需要对抵扣明细进行填报，以便税务机关核实。

请根据具体的税种和当地税务机关的规定进行操作，并确保所有填报的数据准确无误。