货代公司通常需要缴纳的税种包括：

增值税

物流行业提供运输、配送、装卸、搬运等劳务取得的收入，按“交通运输业”缴纳营业税，税率为3%。

货运代理服务属于代理服务业务，按照5%的税率征收营业税。

企业所得税

法定税率为25%，按企业的应纳税所得额计算。

小型微利企业可减按20%征收。

个人所得税

由公司代扣代缴，在工资中扣除后上交税务，起征点为2000元/月。

印花税

合同金额的0.05%，每本账5元，营业执照5元，实收资本的0.05%。

城市维护建设税

按缴纳的营业税的一定比例缴纳，如7%。

教育费附加

按缴纳的营业税的一定比例缴纳，如3%。

房产税

公司租房经营时，按租金的12%缴纳房产税。

土地使用税

按实际占用平方米数乘以规定的单位税额缴纳。

车船税

按车型缴纳定额税。

其他可能的税种

包括仓储保管合同的印花税、财产租赁合同金额的印花税等。

请注意，税率和征收标准可能会根据最新的税法规定和地方政策有所变动，具体情况建议咨询当地税务机关或专业税务顾问