民办非企业单位需要缴纳的税种主要包括：

增值税：

提供的服务或销售的商品，如果涉及应税行为，需要缴纳增值税。

企业所得税：

民办非企业单位作为企业的一种形式，需要按照企业所得税的规定进行申报和缴纳。

个人所得税：

员工工资、薪金等收入达到个人所得税的纳税标准时，需要缴纳个人所得税。

印花税：

在特定经济活动如签订合同、产权转移等情况下需要缴纳。

土地使用税：

使用土地时需要缴纳。

房产税：

拥有房产时需要缴纳。

车船使用税：

拥有并使用车船时需要缴纳。

城建税、教育附加税、地方教育附加税、水利基金：

根据地区政策可能还需缴纳。

具体的税率和申报要求可能因地区和政策差异而有所不同，建议咨询当地税务机关获取最新信息