运输企业的主要收入来源是提供运输服务，这通常被计入企业的主营业务收入。具体来说，运输收入包括货运收入和客运收入，货运收入涵盖长短途整车、零担货运等，而客运收入则包括旅客票价收入和行李运费收入。

在会计处理上，运输企业收到的运费应记入“主营业务收入”科目，这是损益类科目，借贷方向为借减贷增。

需要注意的是，如果运输企业提供的是混合销售行为中的运输劳务，则这部分收入也可以被视作主营业务收入的一部分。

总结一下：

运输企业的收入主要是提供运输服务所得。

运输收入包括货运收入和客运收入。

在会计上，运输收入记入“主营业务收入”科目。