事业单位的专用基金主要包括以下几种：

修购基金：

用于事业单位固定资产的维修和购置。

职工福利基金：

用于单位职工的集体福利设施、集体福利待遇等。

医疗基金：

用于未纳入国家公费医疗经费开支范围的单位职工公费医疗开支。

住房基金：

记录收到的各项住房基金收入（不包括个人缴纳的住房公积金）。

其他基金：

根据其他相关规定提取或设置的专用资金。

专用基金的管理原则包括：

先提后用：各项专用基金必须根据规定的开源渠道，在取得资金后才能安排使用。

专设账户：各项专用基金应单独设账户进行管理和核算。

专款专用：各种专用基金都要按规定用途和使用范围安排开支，确保基金使用合理、合法