处理逾期进项税的问题，企业通常需要遵循以下步骤：

提供证明

企业需要提供相关证明材料，如合同、付款凭证等，以证明逾期进项的真实性。

向税务机关申请

企业应向主管税务机关提出逾期进项税额抵扣的申请。

税务机关审核

税务机关会对企业提供的资料进行审核，确认符合条件后，允许企业抵扣逾期进项税额。

调整申报

企业在后续的纳税申报中，需要对逾期进项税额进行调整，确保申报数据的准确性。

记账处理

企业将逾期进项税额抵扣后，需要在财务账目中进行相应的记账处理。

需要注意的是，逾期进项税额抵扣可能存在一定的限制，企业应尽量在规定期限内完成认证和抵扣，避免不必要的麻烦。此外，逾期申报进项税额可能会受到罚款、滞纳金等处罚措施。

请根据您的具体情况，遵循当地税务机关的规定和流程进行操作。