工程罚款的处理通常遵循以下步骤和原则：

明确罚款目的和依据

罚款旨在纠正施工过程中的质量问题或安全隐患，维护工程质量和安全。

罚款依据包括相关法律法规和合同规定。

遵循罚款程序

建设单位或监理单位发现质量问题或安全隐患后，发出整改通知。

施工单位按要求整改，未按时完成或整改不合格则可能面临罚款。

确定罚款金额

罚款金额根据违规行为的严重程度、对工程质量和安全的影响程度等因素综合考虑。

账务处理

总包单位对施工单位的工程质量罚款可作为工程施工成本的减项，借记“银行存款”，贷记“工程施工”。

法律救济

如果对行政机关的罚款处罚不服，可向作出处罚机构的上级机构申请复议或向同级人民法院提起行政诉讼。

合同条款

建设工程合同中，对承包人违约行为的罚款应视为违约金条款，经承包人确认的罚款数额，发包人可从工程款中扣减。