发票抵扣联的处理通常遵循以下步骤：

检查抵扣联

确保抵扣联完整、清晰，以便正常使用。

保存抵扣联

根据公司或个人的财务管理规定，将抵扣联保存于财务档案中。

保存方式可以是纸质或电子档案，并确保档案整洁、便于查阅。

发票核销

将供应商提供的发票抵扣联归入应付账款，由供应商负责发票核销。

成本核算

设置成本核算政策，确保发票抵扣联被正确使用，避免结算和成本核算问题。

装订和归档

将抵扣联整理好，用夹子夹起，订书机装订，或根据需要使用针线装订。

填写封面数据后，将凭证放入档案室妥善保管。

发票丢失处理

如遇发票丢失，及时联系供货方补开发票，并申请发票认证。