海关负责征收的税种主要包括：

关税：

对准许进出口的货物和进出境物品征收。

增值税：

进口货物的增值税由海关代征。

消费税：

进口的应税消费品的消费税由海关代征。

船舶吨税：

对进出中国港口的船舶征收。

海关在征收上述税种时，会依照相关法律规定，并可能制发缴款凭证。这些税收措施旨在调节国内外产品税收负担的差异，确保公平竞争