民办非企业单位需要缴纳的税种和税率如下：

增值税

小规模纳税人税率：3%

一般纳税人税率：6%-17%

城建税

市区：7%

县城、镇：5%

不在市区、县城或镇：

1%

教育费附加

按增值税的3%缴纳

地方教育费附加

按增值税的2%缴纳

水利基金

按增值税的1%缴纳

印花税

合同按金额的万分之三贴花

所得税

根据利润选择税率，可能为5%，10%，或25%

小型微利企业可能享受优惠税率

土地使用税

大城市：

1.5元至30元/平方米/年

中等城市：

1.2元至24元/平方米/年