企业应补退税的计算通常涉及以下步骤和公式：

确定应纳税所得额

应纳税所得额 = 收入总额 - 成本、费用、税金及附加 - 损失 - 可税前扣除的税金。

计算应纳税额

应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。

计算应补（退）税额

应补（退）税额 = 应纳税额 - 已预缴税额。

如果计算结果为正值，则表示企业需要补缴税款；如果为负值，则表示企业可以申请退税。

示例计算：

假设某企业年度收入总额为100万元，成本费用为60万元，税金及附加为5万元，损失为3万元，没有其他可税前扣除的税金，适用税率为25%，速算扣除数为31920元，已预缴税额为20万元。

应纳税所得额 = 100万元 - 60万元 - 5万元 - 3万元 = 32万元

应纳税额 = 32万元 × 25% - 31920元 = 80000元 - 31920元 = 48080元

应补（退）税额 = 48080元 - 200000元 = -151920元

由于计算结果为负值，企业可以申请退税151920元。

请注意，上述计算仅为示例，实际情况可能涉及更多复杂的扣除项和税率，具体计算应遵循当地税法规定。