增值税专用发票的正确折叠方法如下：

1. 将增值税专用发票的第二联和第三联正面对正面放置。

2. 将这两联纸沿着长的一边对折一次，确保折痕清晰，但不要折叠过多以免影响认证。

3. 如果需要进一步折叠，可以从横板中间折叠，避免折痕影响发票内容。

4. 折叠后，确保发票整洁，没有明显的折痕或破损，以便于存放和携带。

请按照这些步骤进行折叠，以确保发票的完整性和便于后续使用