加尔文和马丁路德对于教会的权威和圣经的解释有不同的看法。

马丁路德认为圣经是唯一的权威，而教会的传统和教义则应该被重新审视和改革。加尔文则认为圣经和教会的传统都是重要的权威，但他更加注重圣经的解释和理解。

最根本区别是宗教思想核心的不同，路德教派主张“因信称义”，即因信仰而得救，而加尔文教派崇尚“先定论”,即得救与否由上帝先定,与后世行为无关。